Przedsięwzięcie jest wzorowane na idei nocy muzeów, kiedy placówki udostępniają darmowo swoje zbiory mieszkańcom.
Podczas Nocy Kościołów będą również prowadzone dyskusje panelowe z udziałem specjalistów dotyczące różnych wymiarów duchowości. Poruszone zostaną takie tematy jak miejsce kobiet w Kościele, ekumenizm czy jedność europejska.
19 czerwca pod bazylika św. Elżbiety odbędzie się jarmark cysterski. Swoje stoiska zaprezentują także licea katolickie z Henrykowa i z Wrocławia.
Tego dnia wieczorem zaplanowane są drzwi otwarte wyższego seminarium duchownego oraz klasztoru sióstr elżbietanek. Do zwiedzania udostępnione zostaną także krypty katedry i klasztor sióstr urszulanek.
Podczas Nocy Kościołów odbędzie się wiele koncertów muzyki sakralnej, miedzy innymi prapremiera kantaty tumskiej „Wrocław - miasto spotkań”. Muzykę do utworu skomponował Francesco Bottigliero, a słowa napisał Janusz Telejko.
20 czerwca w kościele św. Krzyża o godzinie 19. 30 zostanie otwarte wystawa zdjęcia Andrzeja Winiarza 'Totus Tuus”. Są na niej zaprezentowane fotografie związane z życiem i działalnością Jana Pawła II.
Tego dnia będzie obchodzony także jubileusz 150-lecia działalności zakonu sióstr jadwiżanek. Wieczorem będzie można natomiast zwiedzać kościół św. Wojciecha na placu Dominikańskim oraz bazylikę mniejszą pod wezwaniem św. Elżbiety.
Inna propozycja dla wrocławian na 20 czerwca to weekendowe przejście drogą św. Jakuba „Via Regia”. Będzie to rodzaj pielgrzymki po świątyniach rozpoczynający się w Sanktuarium Matki Boskiej Częstochowskiej w Świętej Katarzynie prowadzący przez Ostrów Tumski oraz kościoły Popowic i Kozanowa do Leśnicy.
W ramach Dni Kościołów po południu 20 czerwca na Rynku odbędzie się także finał ogólnopolskiego konkursu „Tato Roku”. W ramach tej imprezy wystąpi Ewelina Flinta i zespół Arka Noego. Przyznane zostaną również certyfikaty Ambasadora Dobrego Serca.